Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AtrxQ61687 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms