Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
AcanQ61282 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms