Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf215Q5SPX3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms