Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mdc1Q5PSV9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mdc1Q5PSV9 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mdc1Q5PSV9 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mdc1Q5PSV9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mdc1Q5PSV9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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