Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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