Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN58

Faap20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap20Q3UN58 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Faap20Q3UN58 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Faap20Q3UN58 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Faap20Q3UN58 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Faap20Q3UN58 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Faap20Q3UN58 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Faap20Q3UN58 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms