Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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