Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cops9Q3U898 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms