Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms