Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms