Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms