Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Sh3bp2Q06649 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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