Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Kcnb1Q03717 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms