Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms