Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms