Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms