Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cds1P98191 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cds1P98191 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cds1P98191 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cds1P98191 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cds1P98191 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cds1P98191 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cds1P98191 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms