Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm43511-201ENSMUST00000197084 2297 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Cited1P97769 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms