Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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