Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rps29P62274 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms