Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl27P61358 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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