Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RorcP51450 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RorcP51450 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms