Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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TspoP50637 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
TspoP50637 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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TspoP50637 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TspoP50637 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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