Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TgfaP48030 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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