Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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