Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprkP35822 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprkP35822 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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