Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VtnP29788 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VtnP29788 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
VtnP29788 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VtnP29788 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VtnP29788 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VtnP29788 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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