Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PrkcdP28867 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms