Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PcnaP17918 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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PcnaP17918 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms