Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms