Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P10404 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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P10404 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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P10404 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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P10404 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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P10404 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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P10404 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P10404 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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