Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms