Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Cd200O54901 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd200O54901 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms