Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3278L7N2D2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3278L7N2D2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms