Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21863J3KMP8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms