Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20830J3KML6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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