Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

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Length 1,769 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tubgcp6G5E8P0 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp6G5E8P0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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