Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf148G3X9R7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf148G3X9R7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf148G3X9R7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf148G3X9R7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf148G3X9R7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms