Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms