Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm28048F7BCN0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm28048F7BCN0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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