Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Krt27Q9Z320 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms