Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms