Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mid2Q9QUS6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms