Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms