Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms