Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Kcnn1Q9EQR3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnn1Q9EQR3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Kcnn1Q9EQR3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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Kcnn1Q9EQR3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnn1Q9EQR3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnn1Q9EQR3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnn1Q9EQR3 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms