Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms