Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp12Q9D9M2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms