Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc6bQ9D289 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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