Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms